Gojira została założona w Ondres (Francja) w 1996 roku przez braci Duplantier – Josepha i Mario – oraz Christiana Andreu. Zespół do 2001 roku funkcjonował pod nazwą Godzilla i wydał cztery deathmetalowe dema: „Victim” (1996), „Possessed” (1997), „Saturate” (1999), „Wisdom Comes” (1999).

Od debiutu („Terra Incognita” 2001), po najnowsze wydawnictwa (singiel „Our Time Is Now”, 2022) Gojira kroczy ścieżką, w której nie poddaje się klasyfikacji gatunkowej. Zespół w swojej twórczości skupia się na tematach związanych z życiem, śmiercią, duchowością, jak również ekologią. Członkowie wielokrotnie angażowali się w aktywizm związany z naturą i destrukcyjnym wpływem ludzkości na klimat oraz prawami człowieka i zwierząt. Owocem tych działań było m.in. wyrażenie poparcia zespołu dla Sea Shepherd – organizacji non-profit działającej na rzecz ochrony przyrody i środowiska morskiego – i jej założyciela, Paula Watsona. Działacz pojawił się on na scenie pomiędzy dwoma utworami Gojira na festiwalu Rock am Ring w Niemczech w czerwcu 2012 roku.

Wydany w 2021 roku utwór „Amazonia” i teledysk do tej piosenki to protest przeciwko wylesianiu lasów deszczowych Amazonii. Za słowami, muzyką i video przyszły też działania – zespół założył miesięczną zbiórkę pieniędzy dla brazylijskiej organizacji charytatywnej zajmującej się prawami rdzennych mieszkańców, Articulation of Indigenous People of Brazil (APIB). Kampania czterokrotnie przekroczyła swój początkowy cel, 75 000 dolarów, a finalna suma wyniosła ponad 300 000 dolarów dzięki sprzedaży pamiątek od takich zespołów jak Metallica, Slayer, Tool i Lamb of God oraz od gitarzysty Guns N’ Roses, Slasha.